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【文獻(xiàn)分享】模塊化自組裝肽納米纖維通過靶向細(xì)菌膜克服耐藥性

來源:艾偉拓(上海)醫(yī)藥科技有限公司   2026年06月12日 16:22  

大家好,艾偉拓產(chǎn)品團(tuán)隊今天向大家分享一篇發(fā)表于《Nature Biomedical Engineering》的高分研究,題目為《Modular peptide nanofibres that self-assemble on bacterial membranes overcome antimicrobial resistance》(模塊化自組裝肽納米纖維通過靶向細(xì)菌膜克服耐藥性)。該研究由來自西湖大學(xué)和哈佛醫(yī)學(xué)院研究團(tuán)隊共同完成。

 

研究團(tuán)隊設(shè)計了一種名為Bip-FK9的模塊化抗菌肽,能夠在細(xì)菌膜上原位自組裝形成納米纖維,選擇性破壞MRSA的膜結(jié)構(gòu),且不誘導(dǎo)耐藥性。

 

一、研究背景


抗生素耐藥性(AMR)已成為全球公共衛(wèi)生的重大威脅,尤其是耐甲氧西林MRSA等耐藥菌引起的感染,治療難度大、死亡率高。傳統(tǒng)抗生素主要通過抑制細(xì)菌內(nèi)部特定靶點(如細(xì)胞壁合成、蛋白合成等)發(fā)揮作用,易因單點突變產(chǎn)生耐藥性。

 

天然抗菌肽(AMPs)通過破壞細(xì)菌細(xì)胞膜殺滅細(xì)菌,不易誘導(dǎo)耐藥性,因而被視為有前景的替代方案。然而,AMPs的臨床轉(zhuǎn)化面臨三大瓶頸:1)分子量大、合成成本高;2)體內(nèi)穩(wěn)定性差;3)對哺乳動物細(xì)胞膜的非特異性毒性?;瘜W(xué)修飾(如糖基化、氟化、脂化)雖能改善部分性能,但常伴隨系統(tǒng)毒性。

 

因此,如何設(shè)計出高選擇性、低毒、穩(wěn)定、低成本的抗菌分子,是該領(lǐng)域的核心挑戰(zhàn)。

 


 

二、核心亮點

 

1.模塊化設(shè)計策略

本研究提出了一種模塊化自組裝肽技術(shù),設(shè)計出名為 Bip-FK9 的分子。該分子由三部分組成(圖1):

①膜錨定基團(tuán)(Bip):增強(qiáng)與細(xì)菌膜的結(jié)合;

②自組裝連接子(FF,二苯丙氨酸):促進(jìn)納米纖維形成;

③最小陽離子肽(FK9):來源于天然 AMP 數(shù)據(jù)庫,具有正電荷和疏水特性。

這種設(shè)計使得 Bip-FK9 能夠選擇性地識別細(xì)菌膜中的磷脂酰甘油(PG),并在其表面自組裝形成納米纖維,進(jìn)而破壞膜結(jié)構(gòu)。

圖1 Bip-FK9的設(shè)計原理示意圖

2. 機(jī)制創(chuàng)新:動態(tài)插入與膜破壞

通過冷凍電鏡(Cryo-EM)(圖2)和全原子分子動力學(xué)(MD)模擬,研究揭示了 Bip-FK9 的作用機(jī)制:

首先在細(xì)菌表面形成短納米纖維;

隨后插入并延展為長纖維,破壞膜電位和通透性;

導(dǎo)致細(xì)菌代謝紊亂、ROS 升高,最終死亡。

重要的是,Bip-FK9 不與細(xì)菌細(xì)胞壁成分(如脂磷壁酸、肽聚糖)結(jié)合,而是直接靶向 PG,這是一種主要存在于細(xì)菌膜、在哺乳動物細(xì)胞膜中極少分布的磷脂,從而實現(xiàn)了高選擇性殺菌。

 

3. 優(yōu)秀的抗菌性能

 

針對MRSA,Bip-FK9的MIC與MBC均為8 μM,并能清除已形成的生物膜。連續(xù)30代傳代未誘導(dǎo)耐藥性,而環(huán)丙沙星第5代即出現(xiàn)耐藥。該肽可回收再利用,循環(huán)使用6次仍保持高效殺菌。僅需128 μM即可清除高濃度MRSA,而萬古霉素需512 μM;殺菌速度優(yōu)于多種經(jīng)典抗菌肽,且對哺乳動物細(xì)胞毒性極低(A549細(xì)胞存活率>90%)。

圖2 Bip-FK9 的表征及體外殺菌活性

 

4. 良好的體內(nèi)療效與生物安全性

 

在 MRSA 誘導(dǎo)的致死性肺炎小鼠模型中(圖3):

①霧化吸入 Bip-FK9 可顯著清除肺內(nèi)細(xì)菌;

②10 天生存率達(dá) 84%,遠(yuǎn)高于萬古霉素組(46%);

③肺部組織結(jié)構(gòu)恢復(fù)良好,炎癥細(xì)胞浸潤減少;

④無體重下降、無明顯免疫反應(yīng)、無主要器官毒性。

 

此外,Bip-FK9 在肺組織和血漿中均表現(xiàn)出良好的穩(wěn)定性,且在肺中滯留時間長達(dá) 4 小時以上。

圖3 Bip-FK9 的體內(nèi)生物安全性評估及在致死性 MRSA

感染模型體內(nèi)的抗感染活性


 

三、總結(jié)

本研究通過模塊化自組裝肽設(shè)計,成功開發(fā)出一種新型抗菌材料 Bip-FK9。該分子利用聯(lián)ben基團(tuán)-二苯丙氨酸-陽離子最小肽三段式結(jié)構(gòu),在MRSA膜上選擇性識別磷脂酰甘油(PG),并原位自組裝形成納米纖維,通過物理破壞膜完整性殺滅細(xì)菌,同時不誘導(dǎo)耐藥性。體內(nèi)外實驗證實其高效、低毒、可回收,在致死性肺炎模型中顯著提高生存率并修復(fù)肺組織。

 

該工作不僅為抗耐藥菌感染提供了具有潛力的候選藥物,也為自組裝多肽材料在抗菌領(lǐng)域的應(yīng)用開辟了新方向,尤其適用于肺部感染、生物膜相關(guān)疾病等難治性感染的治療。


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